如今的科技在不斷的進步，在中藥領域，超微粉碎技術在其應用顯示出一定的優勢。而且，這一項技術的發展，已經為中醫藥現代化帶來新的活力。但在使用中藥材超微粉碎機所體現出的技術在中醫藥領域的應用時間不長，不可避免地會出現一些問題，如：
一、需要根據藥材性質和臨床需要選擇重要的粉碎方法，其中有些適合從藥材本身的性質進行超細粉碎，有些則不適合。
二、中藥材超微粉碎機在發揮單藥藥效、解決煎煮過程中一些煎煮問題和熱分解或水解破壞有效成分等方面具有很大的優勢。
三、超微粉碎技術是一項多學科的高科技粉碎技術，應用于中藥領域，但在工藝、質量控制等方面存在諸多問題。
四、中藥超細粉碎后，由于粒徑減小，易增加表面能，使顆粒處于不穩定狀態；流動性差，易聚集形成假大顆粒；潤濕性增強，易吸濕；吸附性增強，易吸收空氣中的雜質，不利于中藥的制備、保存和運輸。
中藥材超微粉碎機產生的熱量主要來源于兩個方面，其一為機械本身摩擦產生熱量，其二是機械與物料碰撞摩擦等因素產生的熱量。中藥材超微粉碎機的制造工藝精良，機械本身摩擦產生的熱量可以忽略不計；而其粉碎原理巧妙，靠的是碾壓與研磨，并非硬性撞擊剪切，加之本身轉速較低(只有285r/min)，所以產生的熱量遠低于其它粉碎機，更巧妙的是，中藥材超微粉碎機的分選氣流直接通過粉碎槽，在分選的同時，就帶走了絕大部分熱量，所以，中藥材超微粉碎機連續運轉也不會有較高溫度。
在實際測量中，連續運轉的中藥材超微粉碎機機壁溫度不會超過55度，粉末溫度不會超過45度。但是在狹小密閉的環境里，如果空氣不流通，熱量無法傳導出去，有限的空氣被一次又一次加熱，當室內氣溫度都達到了五十幾度將會導致了中藥材超微粉碎機也散熱緩慢，這就需要客戶重新擺放了機器安裝通風設施，這一問題就能得到了良好的解決，所以安裝前一定要對客戶講清楚通風對于正常運轉的重要性。
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